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myPresto の最新版をダウンロードするページです。myPresto は、医薬品開発支援のために作成された分子シミュレーション計算のプログラム集です。

Medicinally Yielding PRotein Engineering SimulaTOr

myPresto は、医薬品開発支援のために作成された分子シミュレーション計算のプログラム集です。

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最新ニュース

myPresto Portal ver.1.1.83 リリース

お知らせ, 更新履歴

機能追加

  • GROMACS によるエネルギー極小化計算と MD計算の機能
  • GROMACS による MD計算の各種トラジェクトリ解析の機能 : gmx energy, gmx rms, gmx rmsf, gmx gyrate, gmx mindist, gmx hbond, gmx rama, gmx covar, gmx anaeig
  • GROMACS によるエネルギー極小化計算と MD計算で各種位置拘束の機能
  • Windows版に gromacs-2021.5 を実装。ただし、Windows 11 および Windows10 以外では GROMACS の動作不可。
  • Linux版とMAC版で、ユーザがインストールした GROMACS のパスを Preference で設定する機能
  • tplgeneXプログラムと力場を 220522版 に更新
  • tplgeneXの水分子の力場に OPC3 を追加
  • [Global Minimize] と [Global Dynamics] の設定ダイアログ表示時に、Preference で MD計算エンジンを変更したときにタスクをリセットする機能
  • Preference で MD計算エンジンを GROMACS に設定したときは、Solvate で Cube をデフォルト設定するようにした。

バグ修正

  • MD計算のトラジェクトリ動画表示で、水分子の長いボンド線を表示する事があるバグ修正
  • [Auto Docking] で、[Find Pocket] – [fast/fast by sitegene] を選択したときに最後までドッキング計算しないバグ修正
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